Además de los modos manuales con los que podremos desarrollar toda nuestra creatividad, la Nikon D5000 cuenta con 19 modos de escena. Como novedad, en adición a los modos Vari-program digitales que encontramos en el dial, tenemos una posición extra del mismo marcada como SCENE. En esta posición, si simplemente giramos el dial accederemos a todos los modos de escena que además se nos mostrarán con una foto de ejemplo.
Como novedad podemos encontrar modos como Luz de velas, Siluetas, Clave alta, o Clave baja.
Una vez tomada nuestra fotografía, la D5000 se convierte en un completo sistema de proceso de imagen pudiendo aplicar a nuestras imágenes hasta 15 funciones de edición y efectos. Aunque, quizá la herramienta de edición más potente sea la de la posibilidad de editar y procesar archivos RAW (NEF) en la propia cámara creando archivos JPEG de alta calidad.