¿Porqué pasa? Como pasa con todo lo que se fabrica en serie se desajustan y el control de calidad no lo detecta o "pasa" hasta un coche de gama alta a veces lo llaman a revisión por algo defectuoso...
Los cuerpos profesionales, de D300 para arriba, tienen ajuste de AF para una cantidad determinada de objetivos, pero lo mejor es que si es muy acusado lo lleves al SAT con el cuerpo de tu cámara y allí te lo ajustan bien, en plan "bricolage casero" ... Ni idea ni si se podría hacer.
Saludos